基因组分析
信息来源:西农生   更新时间:2008/9/2 10:56:01

 

重测序分析:

寻找SNP,indel 插入缺失分析,CNV拷贝数变异分析,群体遗传学等

 

转录位点分析

SNP芯片分析

基因组功能注释与分析

通过生物信息学的方法解读微生物的基因组信息,使人们迅速得获得一个微生物的大部分基因功能信息;利用获取的信息与已知的近缘微生物基因组进行比较分析,进一步挖掘序列背后的生物学意义,为生物学家提供指导。

功能基因组注释
l 基因预测
l 基因功能注释
l 蛋白质功能分类
l 蛋白质亚细胞定位
l rDNA和tRNA基因预测
l IS element和Prophage预测

功能基因组分析
l Paralog和Ortholog计算
l 代谢通路的构建
l 基因岛和水平转移基因的发现
l 基因组多态性的分析
l 基于同源基因的DN/DS计算的进化分析