代谢组UPLC­­­---Q-TOF LC/MS液质联用服务
信息来源:本站原创   更新时间:2010/6/7 17:00:39

                                代谢组学服务UPLC­­­---Q-TOF LC/MS 
 

声明:为保护客户的权益与保密协议,在保证实验结果真实有效的前提下,我们对实验的数据进行了适当的变动处理,简化了实验流程及采样数量。请勿转载!责任自负!

 

使用仪器:液-质联用

UPLC­-----Agilent 1290

Q-TOF LC/MS-----Thermo Orbitrap Elite( 分辨率> 240,000 FWHM) 

AB Triap TOF 5600 +

 

样品信息:

患病组血清样品vs. 对照组血清样品

 

实验流程

通过UPLC­­­----Q-TOF LC/MS分析,分析患病组和对照组血清样品代谢成分,获得代谢组分的实验数据。利用数学分析方法寻找患病组和对照组中具有差异性的代谢组分,建立未知样本分析模型。

 

实验步骤:

 

一、采样

对样本来源进行分组,并记录性别、年龄、病情、治疗等信息;

采集全血,离心后获得血浆/清样本,于-80 冰箱中保存。


血浆/清样本用提取液(甲醇-乙腈)沉淀蛋白,并于-20下提取化合物1 h;高速离心后取上清液,经真空抽干后复溶于甲醇溶液。

 

二、仪器分析及数据预处理(信息峰的提取和识别)

 

      图一  人血清样品典型的LCMS总离子流图(TIC, ESI+m/z 60–1000.)


三、数据分析

 

      图二: 主成分(PCA)得分图:每个点代表一个样本,对照组和患病组样本在CA空间

可以明显的分为两组

 

 

 

 

 

       图三:   偏最小二乘法判别分析3D PLS-DAS-Plot),寻找候选生物标志物,可用

疾病诊断和模型识别

 

 

 

四、差异代谢物鉴定

 

 

 

图四: 高分辨率MS/MS鉴定,右图是左图(一级质谱结果)单峰的二级质谱结果

 

 

 

 

另:生物信息学服务内容:后期数据分析及挖掘

 

  A、疾病识别,诊断模型

 

 B、系统生物学分析

 

 

 

图五: 疾病潜在生物标志物的代谢通路分析,阐释发病机制和生命现象